Свято-Климентовский монастырь находится недалеко от инкерманского автомобильного моста через реку Черная, трассы Севастополь – Симферополь. В монастырь ведет небольшой
тоннель, выйдя из которого вы оказываетесь в монастырском дворе, который ограничен железнодорожным полотном с одной стороны и высокой нависающей скалой (на ней находится крепость Каламита ) с
другой.
На довольно значительной высоте в скале виднеются балкончики с навесами увенчанными крестами. Это церкви, высеченные первыми исповедниками Христа и представляющие собой маленькие
пещеры – крипты с небольшими алтарями. В крипты ведет высеченная в скале узкая крутая лестница, рядом с которой находится маленькая пещера, в которой жил св. Климент, римский епископ в 92-101
годах, сосланный императором Траяном за проповедь христианства в каменоломни близ Херсонеса и убитого здесь в 101 году. Часть мощей святого Климента хранится в монастыре.
Церковь, восстановленная в 1850 году архиепископом Иннокентием, устроившим здесь небольшой монастырь во имя свитых пап Климента и Мартина (римского папы сосланного сюда в VII веке
и принявшего здесь мученическую смерть за веру).
В 1867 году построен дом настоятеля и домовую церковь во имя Святой Троицы, а так же отреставрирован источник святого Климента.
В 1895 году в возведен новый храм в византийском стиле, алтарную часть которого вырублена в скале. Он был освящен в честь великомученника и целителя Пантелеимона.
Некоторые крипты использовались как кельи для монахов. А в 1896 году в монастыре появилась гостиница для паломников.
В 1900 году был освящен древний пещерный храм св. Андрея Первозванного, основание которого относится ко II веку. В 1907 году в память Крымской войны на Инкерманской скале сооружен
величественный храм св. Николая, (24 октября 1854 года на Инкерманских высотах произошла битва в которой семь часов не прекращался рукопашный бой унесший тысячу жизней), к сожалению не
сохранившийся.
На территории монастырского сада сохранился источник, по приданию вода из скалы появилась после молитв св. мученика Климента более 1800 лет тому назад. В 1917 году в киновии жили
25 монахов и 122 паослушника.
Есть сведения, что именно этот монастырь послужил в самом начале 20 века натурой для первой цветной фотографии, сделанной увлеченным фотографией императором Николаем
2.
В годы гражданской войны монастырь поддержал белогвардейцев. Когда в Крым пришла советская власть, земли монастыря были переданы трудовой артели деревни Инкерман.
В 1926 году монастырь был закрыт советскими властями. В монастыре после его закрытия остались жить настоятель архимандрит Венедикт (Чеботарев), отец Прокопий (Кочан) и два
85-летних старца отец Герман (Андреевский) и отец Митрофан (Бороздин).
Во время Великой Отечественной войны в пещерах монастыря разместился штаб 25-ой Чапаевской дивизии Приморской армии. В 1969 году сооружен памятник из белого альминского камня, в
память погибшим войнам в последние дни обороны Севастополя. Он представляет собой стелу, установленную на трехступенчатом основании. Автор - архитектор А. В. Веселов.
Сегодня монастырь стал действующим и посещается многочисленными паломниками и туристами.